El santuario 2 (SN2) parece ser el más arrasado de los dos santuarios de S’Illot, pero seguramente es el que se conserva, a nivel espacial, más íntegro. Su excavación se inició en el año 2016. Por ahora sólo se han registrado los niveles de derribo y reocupación posteriores al periodo postalayótico. El material recuperado consta de numerosas piezas cerámicas que documentan la frecuentación del espacio durante, al menos, los períodos bizantino e islámico. También se documentó un importante conjunto faunístico formado por los restos óseos de los animales que sirvieron de alimento en estas fases, destacando muy especialmente la presencia de gamos durante el período bizantino. Un dato que no había podido ser confirmada desde los años 70 en s’Illot. Por otra parte, también se recuperaron dos puntas de lanza / flecha que constituyen unas de las piezas metálicas más importantes procedentes del yacimiento de s’Illot.